layout: post title: "[习惯养成]周总结 2011/12/5～12/10" date: '2011-12-11T07:47:00.001-09:00' author: Qingyang tags:
<br /><div class="p1"><span class="Apple-style-span" style="font-size: large;">身体：</span></div><div class="p1">本周<span class="s1">锻炼</span><span class="s2">3</span>次，周二没去是因<span class="s1">为前一天练得很累，早上</span>起晚了。周三没去是因<span class="s1">为</span>地<span class="s1">铁</span>晚点，生生的把<span class="s1">时间给</span>耽<span class="s1">误过</span>去了。</div><div class="p1">周四开始采用一套新的<span class="s1">锻炼</span>流程，周四和周五上下身各<span class="s1">练</span>了一次，到<span class="s1">现</span>在肌肉<span class="s1">还</span>有酸痛感，<span class="s1">证</span>明效果不<span class="s1">错</span>。</div><div class="p1">周五下午开始鼻子不通气，要感冒。因此肌肉酸痛也<span class="s1">许</span>是感冒症状？</div><div class="p1"><br /></div><div class="p2"><span class="Apple-style-span" style="font-size: large;">读书<span class="s3">：</span></span></div><div class="p1"><span class="s1">读</span>完了出<span class="s1">轨</span>的往常。女友<span class="s1">给</span>我<span class="s1">发</span>的<span class="s1">电</span>子版，不知道是不是全本。作者的写法不是<span class="s1">严谨</span>的做学<span class="s1">问</span>式的写史<span class="s1">，而是有戏说的成分。读</span>着就是<span class="s1">图</span>一个<span class="s1">乐</span>。我看作者的目的也就是<span class="s1">这</span>个。</div><div class="p2">重新复习了若干时间管理／精力管理／读书方法／自我提升的网文。</div><div class="p2"><br /></div><div class="p2"><span class="Apple-style-span" style="font-size: large;">社交：</span></div><div class="p2">开始在renren和QQ上花点儿时间。我平时用的社交工具都是国外的，国内的朋友都无法登录。以前很排斥国内的网站和聊天工具。现在仍是。但是不能因为排斥工具，连国内的朋友都断了联系呀。重要的是人。</div><div class="p2">比如知道了宝成在民航学院教书，而且仍然单身。知道了miaomiao在参与最新的那本FMRI 数据分析手册的翻译。</div><div class="p2">同实验室的同事祖父去世，却不能回国奔丧。悲伤之际给我打来电话诉说。我很欣慰有朋友在遇到事情时想到我。亲人离世令人悲恸。但愿早日走节哀。好消息是他的夫人也怀孕了。先人升天，后人入世。一悲一喜，何等人生！</div><div class="p2">同Clare聊天，她参加NYC runners club的一个训练课程。每周几天下班后去跑步训练。十次训练$100.</div><div class="p3"><br /></div><div class="p2"><span class="Apple-style-span" style="font-size: large;">工作：</span></div><div class="p2"><b>BASC</b></div><div class="p2">是代码搞好了。红英也把数据准备的差不多了，我们下星期可以开始处理了。准备做海马。</div><div class="p3"><br /></div><div class="p2"><b>Kate的数据</b></div><div class="p2">先是用AFNI处理对准做的很差，试验了用REST，结果很好，但是得先把数据传输到IPN。这个工作我还没有做，因为在两个只能靠VPN链接的服务器之间传数据，是非常让人头疼的。</div><div class="p2">于是又试用了Fcon 的代码。这个运行到一般的时候，服务器硬盘满了。我不知道代码的完成度有多少。80几个被试，并行计算的，也很难知道谁完成了谁没有。我看比较容易的方法是把所有的结果都删除，然后再重新来一次。</div><div class="p3"><br /></div><div class="p2"><b>Rockland short TR TRT数据</b></div><div class="p2">拿到手了第一批数据，都是T1像和用来做基准的REST fMRI （CAP）。Short TR的数据还没有到手。先完成了自动从Dicom到NIFTI的代码，并且运行成功。下一步是修改预处理的代码，可能涉及到重新调整目录结构。把目前的Session／runs的层级目录调成Session?run?/ 形式的单层目录，以求对Fcon 代码的最少改动。 </div><div class="p2">我还得对我自己修改过的Fcon 代码进行注释工作和版本控制。不然的话，版本一多就乱了。现在的版本，在Gelert的short_TR 和Debellis目录下各一个，在IPN的Ipsetica_nyu_trt目录下还有一个。这是目前能想的起来的。</div><div class="p3"><br /></div><div class="p2"><b>BrainNetViewer</b>， </div><div class="p2">同事Chao－gan 编译了Linux和Mac版本。回头也许编译一个windows版本吧。</div><div class="p2">我在虚拟机里面装了一个matlab，也可以干这个事情。</div><div class="p3"><br /></div><div class="p2"><b>FSL</b></div><div class="p2">还是没有搞清楚如何用它做t－test。用Gui是行不通的，至少比我想象的还要麻烦。FSL的作者建议我去ongflameo的命令行去做这件事情。我还没有开始弄。应该给Chao－gan发信，跟他说一下。</div><div class="p3"><br /></div><div class="p4"><b>Compcor</b></div><div class="p5"><span class="s4">Brian </span>写了<span class="s4">Compcor </span>的程序，我修改了fcon script，把它<span class="s5">应</span>用到了数据<span class="s5">处</span>理流程里面。周六的工作就是做了<span class="s5">这</span>件事。用改<span class="s5">动过</span>的代<span class="s5">码处</span>理了24个被<span class="s5">试</span>。下周上班的<span class="s5">时</span>候要去看<span class="s5">这</span>个数据。</div><div class="p6"><br /></div><div class="p5">最后，<span class="s5">发现</span>我的<span class="s5">记时</span>工具<span class="s5">设</span>置的很有<span class="s5">问</span>提，<span class="s5">应</span>当每个任<span class="s5">务都设</span>定一个project，<span class="s5">这样</span>，在看周<span class="s5">总结</span>的<span class="s5">时</span>候，才会更明了。<span class="s5">这</span>个工具，要更好的研究一下。</div>