layout: post title: 一月第四周总结 date: '2011-02-01T12:04:00.001-09:00' author: Qingyang tags:
这一周，我过的总体来说，不很好。<div><br></div><div>周一的开始还好，我去健身房健身了，然后是参加OIE举办的关于毕业之后OPT的一个workshop，获得了一些相关的知识。唯一不清楚的，就是不知道我的专业是不是属于<a href="http://en.wikipedia.org/wiki/STEM_fields" name="STEM">STEM</a>之一，是不是有获得STEM加长OPT的资格。这个得等我更新I20之后才能知道。之后参加了Brett的Journal Club，然后是Job Talk。我得说，上Brett的课给我一些紧迫感，这种紧迫感使得我觉得有些Overwhelmed，然后就突然有什么也不想干的心理了。之后的Job talk也没有听进去多少，其他工作也没有干多好。倒是花了不少时间在实验室新到的电脑上。不过也没有折腾出来啥，装Ubuntu server版老装不上，症状是安装程序认不出硬盘和光驱，各种尝试均告失败。最可恶的是，我的电话在听Job talk时候调成了静音。青锻炼完之后给我打的所有电脑我都没有听到。她在外面等了好久，最后生气的来系里找我了。花了不少时间来安抚她。安抚好她了，可我自己心里还是不很舒服。</div><div><br></div><div>周二的时候我尝试调整，这一天做的还可以。我早上跑了步，5 miles，去了邮局退东西。到系里的时候大概已经10点钟了。我又花了点儿时间，解决了Ubuntu的安装问题，原来在PC上安装时需要选ACPI=off这个选项(<a href="http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=1453292">here is how to turn it off</a>)。之后，把我做的ROI分析的数据重新做了一下图，发给了导师。在图中发现了有一个outlier。后来逐个检查才发向，这个被试的功能像扫描的时候不是Axial slice，而是采取了与AC-PC平行的slice。还没有想好这个该怎么解决。基本上想的是将结构像先deoblique一下，然后后续的分析就当他是正常数据来做。 这天一切完事儿后，我和青青一起去了Habachi 烧烤去吃了日式自助。这个自助不该吃。 吃自助的时时候碰到了喵喵的室友。</div><div><br></div><div>周三，这一天我没有锻炼。这天有几个meeting，一个是一起学<a href="http://www.neurobs.com">Presentation</a>，另外一个是lab meeting。<a href="http://www.neurobs.com">Presentation</a>学习会还好，我给大家大概讲一下我给他们的code，然后让他们提问。最后给了大伙一个建议，让他们自己开始一个小project，开始写代码，我负责给看。我想，如果会读会写一些简单的代码，剩下的就是要在自己遇到问题之后自己去读documentation就好了。lab meeting 提醒我有许多要做的事情我没有做。情绪有开始不好。这天的好事是收到来自NBS的Dr. Woods的信说他们正在看关于H-1B工作签证的事情，如果这个很好解决的话，就会给我买机票让我去面试。我和青青一起研究了一下，写了一封回信给他，说明H-1B应该不是什么问题。但愿他也能得到同样的结论。这一天的时间主要花在了H-1B上。</div><div><br></div><div>周四，事情开始变坏。<a href="http://psychattic.blogspot.com/2011/01/i-had-dream-this-morning.html" name="dream">我做了一个梦</a>，梦到自己肚子疼，然后肚子就真的疼了起来。我给Nicole和Jennifer 发信说得取消转天（周五）的数据演示，然后就开始忍痛。这次疼的不厉害，阅读能是我的注意力转移，疼痛就不那么剧烈了。我问了一下喵喵最近数据处理遇到的问题，并且读了大家往来的邮件，尤其是Ben的邮件，觉得他的alignment 程序里面，同样缺少把功能像与结构像对齐的步骤。我和喵喵，Cindy跟Kara谈了一下这个问题，并且咨询了Ben更多的事情，确认了我的想法。 我把DTI computer上的软件配置好了，装上了<a href="http://www.tcsh.org/">TCSH</a> 和<a href="http://www.google.com/url?sa=t&source=web&cd=1&sqi=2&ved=0CCEQFjAA&url=http%3A%2F%2Fafni.nimh.nih.gov%2Fafni&ei=sHNITfOIM4T6lwepzb2rBA&usg=AFQjCNGc1Zu9X1Utft7vgxZzp_flykoPbg&sig2=gMZ6iQ93tMIYS-sMW2slBg">AFNI</a>，为数据处理做准备。Brett把下周Journal club要讨论的文献发给了大家，我选了其中的一篇看了。选的是Nikolaus Kriegeskorte, Martin A Lindquist, Thomas E Nichols, Russell A Poldrack 和 Edward Vul合写的 Everything you never wanted to know about circular analysis, but were afraid to ask (<a href="http://www.edvul.com/pdf/KriegeskorteEtAl-JCBFM-2010.pdf">PDF</a>)。这篇文章是对08年由Vul的一篇paper引发的fMRI数据分析的大讨论(<a href="http://www.google.com/#hl=en&sugexp=ldymls&xhr=t&q=voodoo+fmri">Search here</a>)的一个总结。在那场从互联网开始蔓延到学术期刊的讨论中，本文的作者中有正方(Kriegeskorte and Vul)和反方(Poldrack)代表，也有支出双方均有正确与错误的中间派(Linguist and Nichols)。这三方五个人在这篇文章里总结了一下这场讨论，并且指出了现在的fMRI数据分析的现状如何，如何正确分析数据，避免错误。文章很好，值得用fMRI作为研究工具的人尤其是初学者读一下。 这一切都是在肚子疼的时候干的。下午的时候，肚子不疼了，我还跑去Ramsey去和青青，喵喵还有韩卓会合打壁球了。回去的时候跟青说了我肚子疼的事。</div><div><br></div><div>周五这天，我决定不去学校了。在家里远程连接学校的电脑，处理了一点工作的事情。洗了一下洗手间的垫子和座套。William来我家，给我送了一口平底锅，并且把它在网上下载的 <a href="http://www.amazon.com/Matlab-Neuroscientists-Introduction-Scientific-Computing/dp/0123745519">Matlab for Neuroscientists</a> 的那本书的附加资料刻成了CD给了我。我发现我家的CD-Rom坏了。其他时间就盯着电脑寻找适合我身材的西服。感觉很不好。</div><div><br></div><div>周六过得堕落，除了出去买菜加跑了步之外，什么也没有做。青青的情绪也低落了起来，整天就是睡觉看电视。</div><div><br></div><div>周日也是这样过的。</div><div><br></div><div>这一周，我跑步两次，健身房一次。共跑步18.2英里。</div><div>吃饭也没有跟上。由于记录不全，至少有500卡的赤字。 不敢多吃了有点儿。</div><div><br></div><div>【写完没检查，欢迎挑错】</div><div><br></div><div><div><br></div></div>