<a href="/GMX/GMXman-0_引言#引言">引言</a>
<a href="/GMX/GMXman-0_谢辞#谢辞">谢辞</a>
<a href="/GMX/GMXman-0_译宣言#译宣言">译宣言</a>
<a href="/GMX/GMXman-0_译后记#译后记">译后记</a>
<a href="/GMX/GMXman-1#第一章 简介">第一章 简介</a>
- <a href="/GMX/GMXman-1#1-1计算化学与分子建模">1.1 计算化学与分子建模</a>
- <a href="/GMX/GMXman-1#1-2分子动力学模拟">1.2 分子动力学模拟</a>
- <a href="/GMX/GMXman-1#1-3能量最小化和搜索方法">1.3 能量最小化和搜索方法</a>
<a href="/GMX/GMXman-2#第二章 定义与单位">第二章 定义与单位</a>
- <a href="/GMX/GMXman-2#2.1 符号标记">2.1 符号标记</a>
- <a href="/GMX/GMXman-2#2.2 md单位">2.2 MD单位</a>
- <a href="/GMX/GMXman-2#2.3 约化单位">2.3 约化单位</a>
<a href="/GMX/GMXman-3#第三章 算法">第三章 算法</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#31-简介">3.1 简介</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#32-周期性边界条件">3.2 周期性边界条件</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#321-一些有用的盒子类型">3.2.1 一些有用的盒子类型</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#322-截断限制">3.2.2 截断限制</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#33-组的概念">3.3 组的概念</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#34-分子动力学">3.4 分子动力学</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#341-初始条件">3.4.1 初始条件</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#342-近邻搜索">3.4.2 近邻搜索</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#343-计算力">3.4.3 计算力</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#344-蛙跳式积分方法">3.4.4 蛙跳式积分方法</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#345-速度verlet积分方法">3.4.5 速度verlet积分方法</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#346-理解可逆的积分方法:trotter分解">3.4.6 理解可逆的积分方法: Trotter分解</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#347-双程截断">3.4.7 双程截断</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#348-温度耦合">3.4.8 温度耦合</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#349-压力耦合">3.4.9 压力耦合</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3410-完整的更新算法">3.4.10 完整的更新算法</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3411-输出步">3.4.11 输出步</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#35-壳层分子动力学">3.5 壳层分子动力学</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#351-优化壳层位置">3.5.1 优化壳层位置</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#36-约束算法">3.6 约束算法</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#361-shake">3.6.1 SHAKE</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#362-lincs">3.6.2 LINCS</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#37-模拟退火">3.7 模拟退火</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#38-随机动力学">3.8 随机动力学</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#39-brown动力学">3.9 Brown动力学</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#310-能量最小化">3.10 能量最小化</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3101-最速下降">3.10.1 最速下降</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3102-共轭梯度">3.10.2 共轭梯度</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3103-l-bfgsd">3.10.3 L-BFGSD</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#311-简正模式分析">3.11 简正模式分析</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#312-自由能计算">3.12 自由能计算</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3121-慢增长方法">3.12.1 慢增长方法</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3122-热力学积分">3.12.2 热力学积分</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#313-副本交换动力学">3.13 副本交换动力学</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#314-主成分动力学抽样">3.14 主成分动力学抽样</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#315-扩展系综动力学">3.15 扩展系综动力学</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#316-并行">3.16 并行</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#317-区域分解">3.17 区域分解</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3171-通讯坐标和力">3.17.1 通讯坐标和力</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3172-动态负载均衡">3.17.2 动态负载均衡</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3173-并行中的约束">3.17.3 并行中的约束</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3174-相互作用范围">3.17.4 相互作用范围</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3175-多程序多数据pme并行">3.17.5 多程序多数据PME并行</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#3176-区域分解流程图">3.17.6 区域分解流程图</a>
- <a href="/GMX/GMXman-3#318-隐式溶剂模型">3.18 隐式溶剂模型</a>
<a href="/GMX/GMXman-4#第四章 相互作用函数和力场">第四章 相互作用函数和力场</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#41-非键相互作用">4.1 非键相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#411-lennard-jones相互作用">4.1.1 Lennard-Jones相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#412-buckingham势">4.1.2 Buckingham势</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#413-库仑相互作用">4.1.3 库仑相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#414-反应场库仑作用">4.1.4 反应场库仑作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#415-修正的非键相互作用">4.1.5 修正的非键相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#416-修改的ewald求和短程相互作用">4.1.6 修改的Ewald求和短程相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#42-键合相互作用">4.2 键合相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#421-键伸缩">4.2.1 键伸缩</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#422-morse势键伸缩">4.2.2 Morse势键伸缩</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#423-立方键伸缩势">4.2.3 立方键伸缩势</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#424-fene键伸缩势">4.2.4 FENE键伸缩势</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#425-简谐角势">4.2.5 简谐角势</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#426-余弦键角势">4.2.6 余弦键角势</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#427-受限弯曲势">4.2.7 受限弯曲势</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#428-urey-bradley势">4.2.8 Urey-Bradley势</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#429-键键交叉项">4.2.9 键键交叉项</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4210-键-角交叉项">4.2.10 键-角交叉项</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4211-四次键角势">4.2.11 四次键角势</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4212-异常二面角">4.2.12 异常二面角</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4213-正常二面角">4.2.13 正常二面角</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4214-表格式键合相互作用">4.2.14 表格式键合相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#43-限制">4.3 限制</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#431-位置限制">4.3.1 位置限制</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#432-平底位置限制势">4.3.2 平底位置限制势</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#433-角限制">4.3.3 角限制</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#434-二面角限制">4.3.4 二面角限制</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#435-距离限制">4.3.5 距离限制</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#436-取向限制">4.3.6 取向限制</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#44-极化">4.4 极化</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#441-简单极化">4.4.1 简单极化</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#442-水极化">4.4.2 水极化</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#443-thole极化">4.4.3 Thole极化</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#45-自由能相互作用">4.5 自由能相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#451-软核相互作用">4.5.1 软核相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#46-方法">4.6 方法</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#461-排除和1-4相互作用">4.6.1 排除和1–4相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#462-电荷组">4.6.2 电荷组</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#463-组方案中截断的处理">4.6.3 组方案中截断的处理</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#47-虚拟相互作用位点">4.7 虚拟相互作用位点</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#48-长程静电作用">4.8 长程静电作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#481-ewald加和">4.8.1 Ewald 加和</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#482-pme">4.8.2 PME</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#483-p3m-ad">4.8.3 P3M-AD</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#484-优化傅里叶变换和pme计算">4.8.4 优化傅里叶变换和PME计算</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#49-长程范德华相互作用">4.9 长程范德华相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#491-色散校正">4.9.1 色散校正</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#492-lennard-jonespme">4.9.2 Lennard-Jones PME</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#410-力场">4.10 力场</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4101-gromos-96">4.10.1 GROMOS–96</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4102-oplsaa">4.10.2 OPLS/AA</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4103-amber">4.10.3 AMBER</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4104-charmm">4.10.4 CHARMM</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4105-粗粒化力场">4.10.5 粗粒化力场</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4106-martini">4.10.6 MARTINI</a>
- <a href="/GMX/GMXman-4#4107-plum">4.10.7 PLUM</a>
<a href="/GMX/GMXman-5#第五章 拓扑文件">第五章 拓扑文件</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#51-简介">5.1 简介</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#52-粒子类型">5.2 粒子类型</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#521-原子类型">5.2.1 原子类型</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#522-虚拟位点">5.2.2 虚拟位点</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#53-参数文件">5.3 参数文件</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#531-原子">5.3.1 原子</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#532-非键参数">5.3.2 非键参数</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#553-键参数">5.5.3 键参数</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#534-分子内的对相互作用">5.3.4 分子内的对相互作用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#535-隐式溶剂化模型">5.3.5 隐式溶剂化模型</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#54-排除">5.4 排除</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#55-约束算法">5.5 约束算法</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#56-pdb2gmx输入文件">5.6 <code>pdb2gmx</code>输入文件</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#561-残基数据库">5.6.1 残基数据库</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#562-残基构建单元数据库">5.6.2 残基构建单元数据库</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#563-原子重命名数据库">5.6.3 原子重命名数据库</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#564-氢数据库">5.6.4 氢数据库</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#565-末端数据库">5.6.5 末端数据库</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#566-虚拟位点数据库">5.6.6 虚拟位点数据库</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#567-特殊键">5.6.7 特殊键</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#57-文件格式">5.7 文件格式</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#571-拓扑文件">5.7.1 拓扑文件</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#572-molecule.itp文件">5.7.2 Molecule.itp文件</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#573-ifdef语句">5.7.3 ifdef语句</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#574-用于自由能计算的拓扑文件">5.7.4 用于自由能计算的拓扑文件</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#575-约束力">5.7.5 约束力</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#576-坐标文件">5.7.6 坐标文件</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#58-力场的组织">5.8 力场的组织</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#581-力场文件">5.8.1 力场文件</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#582-改变力场参数">5.8.2 改变力场参数</a>
- <a href="/GMX/GMXman-5#583-添加原子类型">5.8.3 添加原子类型</a>
<a href="/GMX/GMXman-6#第六章 专题">第六章 专题</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#61-自由能计算的实现">6.1 自由能计算的实现</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#62-平均力势">6.2 平均力势</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#63-非均衡牵引">6.3 非均衡牵引</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#64-牵引代码">6.4 牵引代码</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#65-强制旋转">6.5 强制旋转</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#651-固定轴旋转">6.5.1 固定轴旋转</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#652-柔性轴旋转">6.5.2 柔性轴旋转</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#653-用法">6.5.3 用法</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#66-计算电生理学">6.6 计算电生理学</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#661-使用">6.6.1 使用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#67-使用自由能代码计算pmf">6.7 使用自由能代码计算PMF</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#68-移除最快的自由度">6.8 移除最快的自由度</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#681-氢原子的键-键角振动">6.8.1 氢原子的键-键角振动</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#682-芳香基团的面外振动">6.8.2 芳香基团的面外振动</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#69-粘度计算">6.9 粘度计算</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#610-表格相互作用函数">6.10 表格相互作用函数</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#6101-势能三次样条插值">6.10.1 势能三次样条插值</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#6102-用户自定义势能函数">6.10.2 用户自定义势能函数</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#6.11混合量子经典模拟技术">6.11 混合量子经典模拟技术</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#6111-概述">6.11.1 概述</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#6112-使用方法">6.11.2 使用方法</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#6113-输出">6.11.3 输出</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#6114-未来发展">6.11.4 未来发展</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#612-自适应分辨率方案">6.12 自适应分辨率方案</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#6121-例:水的自适应分辨率模拟">6.12.1 例: 水的自适应分辨率模拟</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#613-vmd插件用于轨迹文件输入输出">6.13 VMD插件用于轨迹文件输入/输出</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#614-交互式分子动力学">6.14 交互式分子动力学</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#6141-准备模拟输入">6.14.1 准备模拟输入</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#6142-启动模拟">6.14.2 启动模拟</a>
- <a href="/GMX/GMXman-6#6143-从vmd中连接">6.14.3 从VMD中连接</a>
<a href="/GMX/GMXman-7#第七章 运行参数和程序">第七章 运行参数和程序</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#71-在线和html手册">7.1 在线和HTML手册</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#72-文件类型">7.2 文件类型</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#73-运行参数">7.3 运行参数</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#731-通用参数">7.3.1 通用参数</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#732-预处理">7.3.2 预处理</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#733-运行控制">7.3.3 运行控制</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#734-langevin动力学">7.3.4 Langevin动力学</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#735-能量最小化">7.3.5 能量最小化</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#736-壳层分子动力学">7.3.6 壳层分子动力学</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#737-测试粒子插入">7.3.7 测试粒子插入</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#738-输出控制">7.3.8 输出控制</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#739-邻区搜索">7.3.9 邻区搜索</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7310-静电">7.3.10 静电</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7311-vdw">7.3.11 VdW</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7312-表格">7.3.12 表格</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7313-ewald">7.3.13 Ewald</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7314-温度耦合">7.3.14 温度耦合</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7315-压力耦合">7.3.15 压力耦合</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7316-模拟退火">7.3.16 模拟退火</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7317-速度产生">7.3.17 速度产生</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7318-键约束">7.3.18 键约束</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7319-能量组排除">7.3.19 能量组排除</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7320-墙">7.3.20 墙</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7321-质心牵引">7.3.21 质心牵引</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7322-nmr精修">7.3.22 NMR精修</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7323-自由能计算">7.3.23 自由能计算</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7324-扩展系综计算">7.3.24 扩展系综计算</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7325-非平衡md">7.3.25 非平衡MD</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7326-电场">7.3.26 电场</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#混合量子经典分子动力学">混合量子/经典分子动力学</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7327-隐式溶剂">7.3.27 隐式溶剂</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7328-自适应分辨率模拟">7.3.28 自适应分辨率模拟</a>
- <a href="/GMX/GMXman-7#7329-用户自定义项">7.3.29 用户自定义项</a>
<a href="/GMX/GMXman-8#第八章 分析">第八章 分析</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#81-使用组">8.1 使用组</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#811-默认组">8.1.1 默认组</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#812-选择">8.1.2 选择</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#82-查看你的轨迹">8.2 查看你的轨迹</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#83-通用性质">8.3 通用性质</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#84-径向分布函数">8.4 径向分布函数</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#85-相关函数">8.5 相关函数</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#851-相关函数的理论">8.5.1 相关函数的理论</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#852-使用fft计算scf">8.5.2 使用FFT计算SCF</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#853-acf的特殊形式">8.5.3 ACF的特殊形式</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#854-acf的一些应用">8.5.4 ACF的一些应用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#86-均方位移">8.6 均方位移</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#87-键距离键角和二面角">8.7 键/距离, 键角和二面角</a>
- <a href="/GMX/GMXman-8#88-回旋半径与距离">8.8 回旋半径与距离</a>
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<a href="/GMX/GMXman-A#附录a技术细节">附录A 技术细节</a>
- <a href="/GMX/GMXman-A#a1-混合精度或双精度">A.1 混合精度或双精度</a>
- <a href="/GMX/GMXman-A#a2-环境变量">A.2 环境变量</a>
- <a href="/GMX/GMXman-A#a3-并行运行gromacs">A.3 并行运行GROMACS</a>
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<a href="/GMX/GMXman-B#附录b一些实现细节">附录B 一些实现细节</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b1-gromacs中的单个和维里">B.1 GROMACS中的单个和维里</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b11-维里">B.1.1 维里</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b12-非键力的维里">B.1.2 非键力的维里</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b13-分子内移位mol-shift">B.1.3 分子内移位(mol-shift)</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b14-共价键的维里">B.1.4 共价键的维里</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b15-shake的维里">B.1.5 SHAKE的维里</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b2-优化">B.2 优化</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b21-水的内部循环">B.2.1 水的内部循环</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b22-fortran代码">B.2.2 Fortran代码</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b3-10sqrt函数的计算">B.3 1.0/sqrt函数的计算</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b31-简介">B.3.1 简介</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b32-通用">B.3.2 通用</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b33-用于于浮点数">B.3.3 用于于浮点数</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b34-备查表格的要求">B.3.4 备查表格的要求</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b35-指数和分数的独立计算">B.3.5 指数和分数的独立计算</a>
- <a href="/GMX/GMXman-B#b36-实现">B.3.6 实现</a>
<a href="/GMX/GMXman-C#附录c平均值与涨落">附录C 平均值与涨落</a>
- <a href="/GMX/GMXman-C#c1-平均值计算公式">C.1 平均值计算公式</a>
- <a href="/GMX/GMXman-C#c2-实现">C.2 实现</a>
- <a href="/GMX/GMXman-C#c21-部分模拟">C.2.1 部分模拟</a>
- <a href="/GMX/GMXman-C#c22-组合两次模拟">C.2.2 组合两次模拟</a>
- <a href="/GMX/GMXman-C#c23-能量项加和">C.2.3 能量项加和</a>
- 2015-11-26 13:08:56
王帅
您好,能给我发一份么?我想打印成纸质的,我的邮箱是2770431947@qq.com
2015-11-26 21:41:23 Jerkwin
直接到中文手册页面去下载pdf即可
2014-12-26 15:02:27 mao
顶,做的很不错
2014-12-26 23:12:12 Jerkwin
谢谢支持.
2015-03-12 10:39:19 steven
很好的平台。赞
2015-03-12 22:33:21 Jerkwin
谢谢.
2015-04-07 18:20:19 momian
您好,我想打印成纸质档方便学习,能给我发一份完整的的吗,谢谢!我的邮箱:405244796@qq.com
2015-04-07 21:31:59 Jerkwin
现在还没有翻译完成, pdf版本的只放在群里供校对使用, 等全部翻译完成了才会把pdf版本的放上来.
2015-04-08 19:04:40 tarot1996
真是太感谢了
2015-04-08 20:37:03 Jerkwin
希望你也能有所贡献.
2015-05-30 08:28:17 yllu
nice
2015-05-30 21:08:13 Jerkwin
发现问题的话, 欢迎指出.
2015-05-30 20:06:47 tarot1996
感谢博主!!!
- 2015-05-30 20:11:29
tarot1996
自己是刚开始接触模拟,什么都不懂,学习手册时专业词汇晦涩难懂。所幸博主即各位有心人士不遗余力翻译手册还提供这么多资料,着实感谢。
2015-05-30 21:09:27 Jerkwin
希望对你有帮助.
2015-06-09 23:09:15 路程
大神啊,膜拜
2015-06-10 08:02:02 Jerkwin
只要愿意付出一点时间, 你也能做到的.
2015-08-05 12:20:00 苏子
之前看了完整的英文手册。现在才发现有这么好东西
2015-08-05 21:35:19 Jerkwin
如果发现翻译有误的地方, 欢迎指出.
2015-10-27 20:31:53 牛人啊,大德不言谢,力赞!
牛人啊,大德不言谢,力赞!
2015-10-27 20:55:26 Jerkwin
过奖了. 谢谢鼓励. 也不只是我自己的功劳.
2015-10-28 20:46:00 杨炎
下载pdf版本不行 大神能发一份到我的邮箱么 1443708775@qq.com 谢谢
2015-10-28 21:01:26 Jerkwin
多试试吧, 根据我的测试, 是可以下载的
2016-03-11 13:35:38 shalene
大德!
2016-03-11 15:22:23 Jerkwin
谢谢鼓励.
2017-01-11 10:22:00 楼主好伟大,让我这个初学MD的人受益匪浅!
楼主好伟大,让我这个初学MD的人受益匪浅!
2017-01-12 23:40:10 Jerkwin
伟大算不上, 尽点绵薄之力而已.
2015-06-03 11:09:16 凌魂
虽然现在没用GROMACS计算数据,但是一直对它有种莫名的情愫,只是那个英文版的用户手册让我纠结了很久,谢谢博主的所为,至少让后来者省了很多力气,以后空闲了,在回头慢慢研读!
2015-06-03 20:30:35 Jerkwin
对你有帮助就好. 欢迎纠错.
2015-06-09 23:09:15 路程
大神啊,膜拜
2015-06-10 08:02:02 Jerkwin
只要愿意付出一点时间, 你也能做到的.
2015-10-27 09:22:57 窄门
博主,下了贵团队翻译的gromacs中文手册,还没用,但心理上已经感觉非常好了。博主的网站还带有文艺范儿,在枯燥的学海中,偶能激起读者情感的涟漪。一张一驰,喜不自禁。
2015-10-27 09:35:27 Jerkwin
多谢鼓励, 希望对你有所帮助.
2016-12-18 11:40:18 玖歌
博主,作为Gromacs初学者看到真的很感动,虽然已经打印了英文的手册决定啃下来= =但看到你们呕心沥血的佳作还是很感动,正如所说,为的是让初学者更快的入门,更有勇气去钻研下去。谢谢你。
- 2016-12-21 00:01:32
Jerkwin
不客气, 希望翻译的手册能让你更好地使用gmx