title: TBtools 快速完成基因功能注释 tags:
基因功能注释质量好坏取决于数据库质量高低，是否全面。于是，本地化进行基因功能注释，需要收集尽可能多的数据库（这个其实很不实际），也需要有较好的计算资源。通过使用网页服务工具，可以克服这个问题。我们可以一直使用最新最全的数据库，同时不需要消耗本地计算资源。
<!--more-->eggNOG-mapper 大名鼎鼎，是一款非常全面，高效，准确，且一直在更新的软件，对应的，该团队提供了网页接口，任何人可以提交蛋白序列文件，在极短的时间内（一般几分钟）完成基因功能注释，包括：具体功能描述信息、Gene Onotoloy 注释信息、KEGG 注释信息、PFAM 注释信息以及其他...
打开 eggNOG-mapper 主页 上传序列文件并输入邮箱，参数一般就使用默认即可，一般使用蛋白质序列
随后就可以看到右键提示
点击 Click to manage your job，启动工作
任务完成后，点击 Access your job files here 查看文件
只需要下载 out.emapper.annotations 这个文件
可以用 Excel 打开文件查看信息
结果很全面，只是还是不能满足我们的需求
接下来我们便使用 TBtools 的 eggNOG-mapper Helper 插件来整理结果
很快就能完成，完成后就可以查看整理好的信息
输出文件中，大家可能最关注的有四个：